Öffne den Ordner, der in der Ordnerstruktur eine Ebene höher als {Civ4-Installationsordner} ist.
Z.B.
C:\Programme\Firaxis Games
Dort erstellst du "einfach" eine Kopie des Civ4-Ordners.
Dann kannst du das "Original" patchen, und je nachdem, ob du mit alten oder neuen Patches spielen willst, benennst du den ensprechenden Civ4-Ordner (alt/neu) so, wie er ursprünglich hieß (und vice versa).