Es werden die Bibliotheken gespeichert. Man macht also die Ordner, die man sichern möchte, zur Bibliothek oder fügt sie einer hinzu. Es lassen sich auch Bibliotheken von der Sicherung ausschließen.
Ich habe dauerhaft eine externe HDD angeschlossen aus Bequemlichkeitsgründen, aber es wird vermutlich auch funktioneren, wenn das nicht der Fall ist.
Schön ist halt auch, dass man eine Versionierung hat.