Ich habe die Beschreibung jetzt noch mal aktualisiert und die bereits bekannte Beschreibung, wie ich Pylint installierte, eingefügt.
Außerdem habe ich ein Batch-Skript beigelegt, dass Pylint so aufrufen würde, wie ich es mir gedacht hätte.
Mein einziger Ratschlag, den ich jetzt noch habe: Pylint deinstallieren und es noch mal über meinen Weg installieren (Wäre dann Version 1.7.X). Getestet habe ich es auf einem Windows 7-System, wo der Fehler mit den Imports dann nicht auftritt.