In aller Regel auf die feindliche Flotte klicken und an den Schiffen gibt es ein Symbol - ich meine mit Lupe - mit dem man die Ausrüstung eines Schiffes sehen kann. Funktioniert bei besonderen Schiffen/Reichen nicht immer (z.B. bei FEs). Wenn du siehst, dass der Gegner z.B. sehr stark auf Schilde geht, kannst du diese mit der passenden Ausrüstung deiner Schiffe leicht ausschalten. Wird hauptsächlich eine Waffengattung genutzt, kannst du dich dagegen besser schützen. Ist ja alles ein bisschen Schere-Stein-Papier.
Ich rate auch ganz stark davon ab, die automatische Bewaffnung aktiviert zu lassen. Hier ist ein halbwegs brauchbarer (evtl. an manchen Stellen teilweise überholt, da Vorgängerpatch) Guide zur Ausrüstung der Schiffe.